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脑影像分析软件推荐| SimTB

2025/8/3 12:25:53 来源:https://blog.csdn.net/NHKJ_ZF/article/details/146873947  浏览:    关键词:脑影像分析软件推荐| SimTB

目录

1. 软件界面

2.工具包功能简介

3.软件安装注意事项


1. 软件界面

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2.工具包功能简介

SimTB 是一个 Matlab 工具箱,允许在时空可分离性模型下灵活生成 fMRI 数据集,旨在促进各种分析方法的测试。用户可以完全控制生成的数据集,包括创建和操作空间源、实施与块和事件相关的实验设计、包含组织特异性基线、模拟头部运动等。MATLAB 入门用户可以使用 SimTB GUI和脚本来生成模拟数据。

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GUI基本操作

1、在命令行输入sumtb

2、Initialize:参数设置

a)设置输出文件夹前缀,多个模拟数据能够在有相同前缀的输出文件夹中储存;设置文件格式(.mat或.nii)

b)设置模拟数据维度:被试数目、成分数量、时间点数量、TR等

3、设置成分空间成分:设置不同空间成分对应的标签、空间成分的个数,每个空间成分是否在每个被试中出现(component presence/absence),以及其位移(x or y-translation)、放缩(rotation)度数

4、时间进程设置

5、噪声设置:添加随机噪声和头动噪声

6、可视化

3.软件安装注意事项

需要将SimTB和其子文件夹添加到Matlab路径中,后在命令行输入simtb

参考文献

Erhardt, E. B., Allen, E. A., Wei, Y., Eichele, T., & Calhoun, V. D. (2012). SimTB, a simulation toolbox for fMRI data under a model of spatiotemporal separability. Neuroimage, 59(4), 4160-4167.

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