高端复杂的UMAP复现:
这又是一个高大上且炫酷的单细胞UMAP图,展示的信息很多,有大类细胞和亚群,以及marker基因和cell count信息,还可以增加其他的分组信息等等。没错,看这个图就是circlize一层层画的。我们复现的结果如下:
1、需要注意的是最后的UMAP和环形图建议手动拼接更方便。
2、环形图的思路上与原文的图有些不同,可以明显看出,我们的图是直接分扇区画的,原文的图是一起画的。我们的好处在于画图简洁,容易理解。当然为了让这个过程清晰,因为代码确实有点长,提供了视频解说教程!
3、我们的环形图颜色是围绕UMAP图画的,原文很随心,没有考虑两者位置关系!
我们效果如下